Né en 1957 à Perpignan, Jacques Moret effectue ses études secondaires à Avignon puis ses études supérieures à l’université de Provence à Marseille. Il obtient un Capes de sciences naturelles en 1980, une agrégation de sciences naturelles en 1981, puis un doctorat en écologie en 1985. Il est habilité à diriger des travaux de recherche (HDR) depuis 1988.

Sa carrière débute dans l’enseignement secondaire en tant que professeur agrégé de sciences naturelles en lycée à Champigny-sur-Marne (94), puis en collège à Corbeil-Essonnes (91).

Son parcours se poursuit ensuite au Muséum national d’Histoire naturelle où il est d’abord nommé en 1988 sur un poste de sous-directeur de laboratoire, puis en 1992 sur un poste de professeur du Muséum au laboratoire de biologie végétale appliquée.
Ses recherches portent sur l’écologie (en particulier sur l’écologie urbaine dont il a été l’un des initiateurs en France), la gestion de la biodiversité et l’éducation à l’environnement.

En 1995, il crée le Conservatoire botanique national du bassin parisien, établissement scientifique et d’expertise du ministère chargé de l’environnement, dont il assure les directions administrative et scientifique jusqu’en 2009.
De 2002 à 2007, il dirige l’unité mixte CNRS Inventaire et suivi de la biodiversité.

De 2009 à 2010 il est directeur de l’Institut national de recherche pédagogique (INRP).

De 2011 à 2012 il est délégué à la recherche et à la technologie (DRRT) en région Languedoc-Roussillon.

Entre 2003 et 2011, il préside la section 67 (écologie) du Conseil national des universités. En 2004, il est l’un des promoteurs de la création de la Conférence permanente du Conseil national des universités (CP-CNU) dont il assure la vice-présidence de 2004 à 2008, puis la présidence de 2008 à 2009.

Il s’est toujours investi dans les politiques de l’environnement. Entre 2005 et 2010 il assure, en particulier, la présidence de l’Observatoire de la biodiversité urbaine de Seine-Saint-Denis et a été nommé par le gouvernement correspondant français pour la stratégie mondiale de conservation des plantes de 2006 à 2010.
De 2009 à 2011 il a été membre de la Commission française pour l’éducation de l’Unesco.

Il a été nommé recteur de l’académie de Poitiers, chancelier des universités lors du conseil des ministres du 28 septembre 2012.

Il est : chevalier des Palmes académiques (2001) et chevalier de l’Ordre national du Mérite (2010).